연구소는 해양생물자원 연구, 해양생태 연구, 미래자원연구, 해양개발 및 오염 방지, 해양산업의 고부가가치화를 위한 디자인 연구, 경영 자문 등을 연구할 수 있는 해양 관련 종합연구소로서, 21세기 해양 강국 시대를 이루기 위한 해양 관련 산업 육성 전략에 맞춰 차별화된 학제간 연구를 통하여 산학 협동연구 및 우수한 인력양성을 그 목적으로 한다.

• 기능성 해양생물 신소재의 개발 분과
• 연안생태환경 보전기술 개발 분과
• 차세대 해안공간 확보기술 개발 분과
• 해양 및 연안 문화연구 분과
• 대외협력 분과
• 출판 분과

• 연구소의 임원 (소장: 1인, 분과책임자 : 6인)
• 소원은 연구교수, 전임연구원, 객원연구원, 연구기능원, 행정원으로 구성

• 기능성 해양생물 신소재의 개발
• 해양생태환경 보전기술 개발
• 차세대 해안공간 확보기술 개발
• 해양건축/해양토목 관련 연구
• 해양관련 법 및 제도 연구
• 해양 및 연안 문화 연구
• 각종 세미나, workshop 및 심포지움 개최
• 외부 연구원의 수탁 교육
• 연구 문헌 정보의 수집 및 제공
• 연구기기의 공동 활용 및 서비스 등